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服用吉瑞替尼需密切关注一系列潜在副作用。最常见的是血液学毒性，包括贫血、血小板减少和发热性中性粒细胞减少，需定期验血监测。分化综合征是重要风险，表现为发热、呼吸困难、体重迅速增加等，需立即就医，可能需暂停药并使用激素治疗。其他常见反应包括转氨酶升高（监测肝功能）、肌肉关节疼痛、疲劳、恶心腹泻等。此外，它可延长心电图QT间期，有心脏基础病或服用其他延长QTc药物的患者需定期检查心电图。患者应了解这些副作用迹象，一旦出现异常及时与医生沟通，以便及时处理。
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